Die ev. Kirchengemeinde St. Sebastian liegt im Magdeburger Stadtteil Lemsdorf und bildet mit der St. Michaels Gemeinde, mit der St. Ambrosius Gemeinde, der Christus Gemeinde und der Philippus Gemeinde das Evangelische Kirchspiel Süd.
Die Grundsteinlegung für die Lemsdorfer Kirche fand 1889 statt. Die Kirche wurde am 9. November 1890 geweiht. An der Südseite des Kirchturms wurde 1936 ein Gemeindehaus gebaut. In der Kirche befindet sich eine 1890 von Eduard Beyer, Magdeburg, erbaute Orgel.